С образованием в городе Душанбе филиала Новосибирского института советской кооперативной торговли в 1987 году кафедра учетно-экономических дисциплин начала свою деятельность под руководством  кандидата экономических наук, доцента Сангинова Н.С.

В 1992 году на базе предыдущей кафедры была создана кафедра учета и финансов, заведующей которой был с 1992 года по 1994 годы к.э.н., доцент Туробов М.Ш.

С 1994 года была организована кафедра бухгалтерского учета и аудита, которую в 1994-1995 гг. возглавлял к.э.н., доцент Акобиров З.Н. Далее с 1995 года по 1997 года заведующим кафедрой являлся  к.э.н., доцент Шерназаров А.Ш. 

Яркий период деятельности кафедры начался с 1997 года под руководством кандидата экономических наук, доцента Менгниева Абира Хушвахтовича. В 1999 году кафедра впервые в университете начал реализацию проекта международного фонда Евразия под названием «ИнтерАудит ТJ» и именно по инициативе кафедры в 2000 году была создана первое профессиональное объединение бухгалтеров страны - Общественного Института профессиональных бухгалтеров и аудиторов Республики Таджикистан, успешно функционирующий уже на протяжении 19 лет.

Преподаватели кафедры первыми в республике стали обладателями международно-признанных сертификатов профессионального бухгалтера, и до сих пор являются ведущими тренерами курсов профессиональной сертификации международных сетей CIPA, ACCA, GARP и т.д. С 2008 года по 2012 год кафедру возглавлял к.ф.м.н. доцент Зарипов Э.Ш., являющимся одновременно и сертифицированным профессиональным бухгалтером. С 2012 года до ныне заведующим кафедрой является воспитанник кафедры к.э.н., доцент Мирзоалиев А.А.

В течении периода функционирования кафедры целый ряд преподавателей – известных ученых как доценты Алимардонов У.А., Садиков С.И., Камилов Ш., Махмадшоев Дж., Саидов Ф, Маъдиев С., Нурмухаммедова Х., Рахимов С.Х., Низомов С.Ф., Каримов Б.Х., Ходжиев Г.Х., Рахимов Г.М., старшие преподаватели Давлатмамадов М., Азизмуродов Ш.Х., Мирзоев К.Р., Мирзоева Ф.У., Саидов Дж.А., Саидова Д.А., Муродова М.,  Зотова О.Н., Каландаров С., Бозоров Н., Давлатов А., Бобоев Ш.Н,, Субхонќулов И., Бадалов Х.,Шаропов А.Дж., Хусайнов С.С., ассистенты Шерова М., Бобишоев М.Н., Халимов П.А., Мамаднаимов Ш., Тураева М., Сангинова Ш., Ашуров Ф., Раджабов О., Одинаев Дж.О., Додарбеков С. и др. успешно вели свою профессиональную, учебную, учебно-методическую и научно-исследовательскую работу.

Многие члены кафедры являются профессионально практикующими бухгалтерами и обладают огромными профессиональными навыками вместе с учебной деятельностью. Преподаватели Саидов Дж.А., Мирзоалиев А.А., Зарипов Э.Ш., Саидова Д., Садиков С.И., Азизмуродов Ш.Х., Хусайнов С.С. являются сертифицированными международными бухгалтерами, и в настоящее время Рахимов Г.М., Ходжиев Г.Х., Бадалов Х. и другие находятся на пороге получения международного признания. Все перечисленные преподаватели являются действительными членами Общественного Института профессиональных бухгалтеров и аудиторов Республики Таджикистан и вносят весомый вклад в развитии профессии бухгалтера и его международного признания, внедрении Международных стандартов профессионального бухгалтерского образования (IES), финансовой отчетности (IAS/IFRS) и аудита и выражения уверенности(ISA).

Кафедра готовит компетентных и высококвалифицированных специалистов на уровне бакалавриата по специальностям 1-25010812 «Бухгалтерский учет, анализ и аудит в коммерческих предприятиях», 1-25010801 «Бухгалтерский учет, анализ и аудит в банках», 1-250111 – «Аудит и ревизия»,  и на уровне магистратуры и докторантуры по специальности 1-25010800 «Бухгалтерский учет, анализ и аудит».